2021年5月21日金曜日

Rをjupyterで

 ラベル付き散布図を描きたいのだ。なかなかうまく探しきれず,Rが一番手っ取り早そうなので,Rをjupyterから使えるようにすることを試みた。

とりあえず,brewでRをインストールすると最新のarm版だった。

brew install R
R —version
R version 4.1.0 (2021-05-18)
次にコマンドラインでRを起動し,R環境の中で3つのコマンドを実行する[1]。
>install.package(“devtools”) … CRAN ダウンロードは Japan/Tokyo 47 から

1つ目のコマンド(上記)で次のエラーが出てしまった。

>1: install.packages("devtools") で:
> installation of package ‘gert’ had non-zero exit status
>2: install.packages("devtools") で:
> installation of package ‘usethis’ had non-zero exit status
>3: install.packages("devtools") で:
> installation of package ‘devtools’ had non-zero exit status
>> Configuration failed to find libgit2 library. Try installing:
> * brew: libgit2 (MacOS)

そこで,brewでlibgit2をインストールしてから再挑戦する。
brew install libgit2
R
> install.packages("devtools")
> devtools::install_github("IRkernel/IRkernel")
> IRkernel::installspec()
jupyter lab … これで OK!
これでうまくいった。

写真:jupyterlabの起動画面

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